在近四萬個藥學反應數據集上驗證——機器學習加速新藥研發進程

英國劍橋大學和美國輝瑞公司合作開發了一個平臺,將自動化實驗與人工智能(AI)相結合,以預測化學物質如何相互反應,從而加速新藥的設計過程。研究結果發表在最新一期《自然·化學》雜志上。
預測分子如何反應,對于新藥的發現和制造至關重要。但從歷史上看,這是一個反復試驗、經常失敗的過程。為了進行預測,化學家需要在模型中模擬電子和原子,這一過程計算成本高昂且通常不準確。
現在,研究人員開發了一種受基因組學啟發的數據驅動方法。該方法將自動化實驗與機器學習相結合,以了解化學反應性,從而大大加快了新藥設計過程。他們稱,該方法在超過39000個藥學相關反應的數據集上得到了驗證。
該方法從數據中挑選出反應物、試劑并測試反應性能之間的相關性。數據則是通過非常快速或高通量的自動化實驗生成的。研究人員表示,高通量化學已經改變了游戲規則。他們相信有一種新方法,可促進對化學反應的更深入的理解,而不是從高通量實驗的初始結果中觀察到。此次開發的這種機器學習方法,就能允許化學家調整復雜的分子,再精確引入到分子的預先指定區域,從而加快藥物設計速度。
機器學習以往在化學中的應用經常受到限制。與廣闊的化學空間相比,其數據量實在太小。但此次研究通過“傳授”給模型一般化學知識,然后對其進行微調,預測復雜的化學轉化,從而克服了低數據的局限性。
論文第一作者、劍橋大學卡文迪許實驗室的艾瑪·金-史密斯表示,這一成果可能會改變人們對有機化學的看法。對化學的更深入理解,亦可促使人們更快速制造藥品和許多其他有用的化學品。
總編輯圈點
高通量技術是利用高度自動化的系統,對大量樣品進行快速檢測和分析。在節省人力和時間的同時,能提高分析的準確性。不過,科研人員不滿足于僅使用高通量技術,還加上了人工智能這一“利器”。他們引入機器學習方法,預測復雜的化學反應是如何進行的,以加快藥物設計速度。新藥研發通常是一個漫長且充滿挫折的過程,猶如大海撈針。新技術則給了研發者一張“地圖”,指出了可能藏有“寶藏”的具體區域,從而加速了研發進程。
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